La FDN se caracteriza por adelantar una gestión transparente y plenamente enmarcada en el cumplimiento de la Ley y la reglamentación que la rige. 

Dada su naturaleza de corporación financiera, sus acciones se encuentran vigiladas por la Superintendencia Financiera.

Adicionalmente, está bajo el control y seguimiento de la Contraloría General de la República y la Revisoría Fiscal.